自然来源或者重组表达的蛋白质经过一些粗提的步骤（例如：匀浆、离心、硫酸铵沉淀等）成为稳定的可以用于色谱分离的样品。

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酵母双杂交系统是目前最为广泛的一种蛋白质相互作用研究方法，其中，从cDNA文库中筛选出与已知蛋白存在特异相互作用的蛋白是酵母双杂交系统最为重要和广泛的用途。

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反应珠法每接上一个氨基酸，就重复脱保护-均匀混合-等分-与带活化酯的羟基组分缩合过程，每一循环开始时，反应器中反应物是“统计学纯”分布，直到完成。

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